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      兩會(huì ) | 全國人大代表、廣州國家實(shí)驗室研究員蔣太交:布局建設國家生物數據中心體系粵港澳大灣區節點(diǎn)

      發(fā)布日期:2024-03-09 ??? 來(lái)源: 中國城市網(wǎng)

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      生命健康科學(xué)研究已進(jìn)入數據密集型大模型時(shí)代,而生物數據庫主要由美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)和歐洲生物信息學(xué)研究所(EBI)兩個(gè)中心領(lǐng)導,中國在這個(gè)方面缺乏國際影響力。EBI負責人Rolf Apweiler指出兩個(gè)問(wèn)題:中國缺少一個(gè)明確的代表性科學(xué)中心可以代表中國接軌國際;中國科學(xué)家使用了歐洲生物信息學(xué)研究所超過(guò)三分之一的資源,但在數據和數據庫維護上缺乏貢獻。黨中央高度重視生物大數據資源發(fā)展,提出了國家生物數據中心“1+N”體系建設思路。國家發(fā)改委先期聚焦組學(xué)數據立項了“1”國家生物信息中心,“N”僅聚焦文獻數據立項了國家生物醫學(xué)文獻信息中心,尚缺乏以疾病為核心的系統全面的數據資源。

      粵港澳大灣區建設,是習近平總書(shū)記親自謀劃、親自部署、親自推動(dòng)的重大國家戰略,也是我國經(jīng)濟發(fā)展重要區域與對外經(jīng)貿交流的南大門(mén),GDP超全國總量12%,其中,大健康產(chǎn)業(yè)是粵港澳大灣區核心支柱產(chǎn)業(yè)之一。通過(guò)大數據的匯聚和關(guān)聯(lián)分析能夠更快、更直接地發(fā)現新知識、新機制、新規律,驅動(dòng)新技術(shù)、新成果的快速誕生與產(chǎn)業(yè)應用。據文獻報道,以“臨床+多組學(xué)”為主的生物醫學(xué)數據基礎設施支持了2/3以上FDA獲批的原研藥研發(fā)工作,每年獲得巨額產(chǎn)業(yè)回報。因此,建設支撐生命健康科學(xué)研究與生物醫藥產(chǎn)業(yè)創(chuàng )新發(fā)展的生物醫學(xué)數據節點(diǎn),既是粵港澳大灣區經(jīng)濟持續繁榮的必然要求,也是落實(shí)粵港澳大灣區國家戰略的重要支撐。

      近百年來(lái),對人類(lèi)生命健康產(chǎn)生深遠影響的重大突發(fā)公共衛生事件無(wú)一不是由呼吸系統傳染病導致的?;浉郯拇鬄硡^地處亞熱帶,氣候溫和適合病毒傳播,同時(shí)還是我國對外經(jīng)貿交流的南大門(mén),入境人數占全國90%以上,常住人口超8000萬(wàn)人,是傳染病“外防輸入、內防傳播”的重點(diǎn)區域。在粵港澳大灣區建立支撐呼吸系統傳染病監測預警與快速主動(dòng)應對的生物醫學(xué)數據節點(diǎn),是及時(shí)了解疫情動(dòng)態(tài)、制定科學(xué)有效防控策略的必要手段。通過(guò)收集并加以整理分析區域內生物醫學(xué)數據與境內外呼吸道傳染病的病例數據、病毒基因序列、人體多組學(xué)數據、流行病學(xué)信息等重要數據,可及時(shí)了解全球范圍內呼吸道傳染病疫情的頻發(fā)和傳播速度、疫情動(dòng)態(tài)與防控策略,發(fā)現疫情的時(shí)空分布規律、預測疫情的爆發(fā)趨勢,為公共衛生防控決策提供決策支持和科學(xué)依據,最大程度地保護我國人民群眾的健康安全。

      因此,廣州國家實(shí)驗室作為國家戰略科技力量,以解決新發(fā)突發(fā)病原重大疫情預測預警、呼吸系統疾病及其防控領(lǐng)域關(guān)鍵核心為己任,有意愿、有能力承建與長(cháng)期運行國家生物數據中心體系粵港澳大灣區節點(diǎn),助力我國生命健康科學(xué)研究與生物醫藥產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。

      在廣東省廣州市的支持下,廣州國家實(shí)驗室開(kāi)展了前期工作,在軟硬件、數據資源和管理模式上已形成完善的小試到中試的技術(shù)能力,獲得了一系列初步成果,并具備清晰可落地的技術(shù)和市場(chǎng)轉化服務(wù)路徑。比如自主研發(fā)了支撐大規模算力資源管理、智能工具開(kāi)發(fā)與集成、大模型驅動(dòng)到跨平臺資源共享的市場(chǎng)化工業(yè)軟件系統—“生物醫學(xué)大數據操作系統(Bio-OS)”;接入了50萬(wàn)余全球人類(lèi)基因組數據集、10000余算子鏡像;匯聚了15PB數據;建成了27億參數垂直領(lǐng)域大模型;啟動(dòng)了百萬(wàn)呼吸健康人群隊列研究,以及生物醫學(xué)科研與數據治理大模型建設;與全國近1000家醫院達成戰略合作協(xié)議,與多所港澳科研機構建立戰略合作關(guān)系;建設了5年可產(chǎn)出約400PB高質(zhì)量多組學(xué)數據與基礎實(shí)驗數據的全鏈條科研平臺。

      建議充分發(fā)揮國家實(shí)驗室“總平臺總鏈長(cháng)”作用,以及廣州國家實(shí)驗室在生物醫藥領(lǐng)域深厚積淀,建設面向呼吸系統疾病領(lǐng)域的“國家生物數據中心體系粵港澳大灣區節點(diǎn)”。